Fragen mit dem Tag [snakemake]

stimmen
5
antworten
4
aufrufe
490
Emacs-Modus für snakemake?
Veröffentlicht am 15/06/2013 um 20:08
vom benutzer user2489449
stimmen
0
antworten
0
aufrufe
89
Ungültige Zeiger und Variable nicht definiert Fehler
Veröffentlicht am 11/08/2015 um 10:03
vom benutzer Marcel M
stimmen
0
antworten
2
aufrufe
476
Probleme mit Pandas installieren - mehrere Versionen von Python läuft
Veröffentlicht am 24/08/2015 um 10:52
vom benutzer rioualen
stimmen
0
antworten
1
aufrufe
66
Looping durch Listen von Dateien mit bash - Syntaxfehler
Veröffentlicht am 31/08/2015 um 14:40
vom benutzer rioualen
stimmen
2
antworten
2
aufrufe
537
Immer laufen Regel in Snakefile (snakemake)
Veröffentlicht am 08/04/2016 um 10:05
vom benutzer Chris
stimmen
2
antworten
2
aufrufe
202
Pipeline Programmierung parallel
Veröffentlicht am 17/06/2016 um 18:21
vom benutzer VickiT05
stimmen
0
antworten
1
aufrufe
1k
Prozess mehrere Verzeichnisse und alle Dateien innerhalb snakemake mit
Veröffentlicht am 21/06/2016 um 20:27
vom benutzer VickiT05
stimmen
0
antworten
1
aufrufe
776
Re-write schreibgeschützte Datei
Veröffentlicht am 29/06/2016 um 13:04
vom benutzer VickiT05
stimmen
0
antworten
0
aufrufe
231
Ist es möglich, zu erhalten yapf Teile einer Datei zu ignorieren?
Veröffentlicht am 08/07/2016 um 07:49
vom benutzer The Unfun Cat
stimmen
2
antworten
1
aufrufe
69
Warum Einstellung `wildcard_constraints` in einem snakefile verhindert das Löschen von Dateien` temp` gekennzeichnet?
Veröffentlicht am 26/10/2016 um 11:12
vom benutzer bli
stimmen
3
antworten
2
aufrufe
466
Wie ein Teil erweitert in Snakemake zu tun?
Veröffentlicht am 03/11/2016 um 09:37
vom benutzer bli
stimmen
1
antworten
2
aufrufe
291
Kann snakemake Zweideutigkeit vermeiden, wenn zwei verschiedene Regelpfade einen bestimmten Ausgang erzeugen kann?
Veröffentlicht am 09/11/2016 um 15:19
vom benutzer bli
stimmen
2
antworten
1
aufrufe
86
Mit „snakemake --config“ Flags auf einen Befehl zu übergeben
Veröffentlicht am 09/11/2016 um 15:53
vom benutzer user3213137
stimmen
3
antworten
2
aufrufe
1k
Snakemake: Name Regel statt Zieldatei
Veröffentlicht am 10/11/2016 um 23:08
vom benutzer blaurent
stimmen
1
antworten
1
aufrufe
115
Wie explizite und implizite Regeln in Snakemake auszudrücken?
Veröffentlicht am 13/11/2016 um 10:13
vom benutzer Stephan
stimmen
0
antworten
2
aufrufe
237
Zugriff auf Log-Dateien von snakemake Regeln erstellt
Veröffentlicht am 15/11/2016 um 05:49
vom benutzer Andreas
stimmen
0
antworten
1
aufrufe
656
Wie kann ich eine Zeichenfolge in der Konfigurationsdatei in den Ausgabeabschnitt passieren?
Veröffentlicht am 18/11/2016 um 00:27
vom benutzer olala
stimmen
2
antworten
1
aufrufe
517
snakemake: Wie mit variabler Anzahl der Ausgabe von der Regel behandeln
Veröffentlicht am 18/11/2016 um 21:04
vom benutzer olala
stimmen
0
antworten
1
aufrufe
41
Bioconda: simulate-travis.py schlägt fehl, weil api nicht aus conda_build importiert werden können
Veröffentlicht am 21/11/2016 um 02:28
vom benutzer Andreas
stimmen
1
antworten
1
aufrufe
95
Verhindern snakemake aus machen Ausgabeverzeichnis
Veröffentlicht am 21/11/2016 um 21:36
vom benutzer Harold
stimmen
0
antworten
1
aufrufe
57
bioconda: Keine solche Datei oder das Verzeichnis verrührten-build
Veröffentlicht am 22/11/2016 um 15:39
vom benutzer Andreas
stimmen
0
antworten
1
aufrufe
213
Snakemake Cluster-Konfiguration in Kombination mit DRMMA
Veröffentlicht am 23/11/2016 um 16:43
vom benutzer fitziano
stimmen
2
antworten
1
aufrufe
346
Snakemake: Abhängigkeiten, die nicht eingegeben werden
Veröffentlicht am 25/11/2016 um 10:27
vom benutzer blaurent
stimmen
0
antworten
1
aufrufe
96
Snakemake beklagt es die Datei nicht finden kann, es soll in einem Lauf Anweisung erstellen
Veröffentlicht am 02/12/2016 um 16:09
vom benutzer bli
stimmen
3
antworten
4
aufrufe
1k
snakemake: Gibt es eine Möglichkeit, ein Ausgabeverzeichnis für jede Regel angeben?
Veröffentlicht am 02/12/2016 um 21:40
vom benutzer olala
stimmen
3
antworten
2
aufrufe
182
Aktuelle Regel Name in Snakemake
Veröffentlicht am 05/12/2016 um 13:59
vom benutzer glihm
stimmen
1
antworten
2
aufrufe
293
Snakemake: entfernen Ausgabedatei
Veröffentlicht am 06/12/2016 um 13:30
vom benutzer blaurent
stimmen
3
antworten
2
aufrufe
363
Die Wiederverwendung von in der Regel in Snakemake
Veröffentlicht am 06/12/2016 um 16:17
vom benutzer glihm
stimmen
1
antworten
1
aufrufe
49
Installieren snakemake ohne Internet
Veröffentlicht am 11/12/2016 um 18:36
vom benutzer MichelleN
stimmen
0
antworten
1
aufrufe
84
Snakemake + tmux
Veröffentlicht am 11/12/2016 um 19:26
vom benutzer domino55
stimmen
-1
antworten
1
aufrufe
150
snakemake LSF Fragen
Veröffentlicht am 13/12/2016 um 12:38
vom benutzer naamako
stimmen
2
antworten
0
aufrufe
139
Snakemake best practice für Demultiplexing
Veröffentlicht am 14/12/2016 um 05:57
vom benutzer kdmurrray91
stimmen
1
antworten
1
aufrufe
510
Wie benutzt man in snakemake zu erweitern, wenn einige bestimmte Kombinationen von Wildcards sind nicht erwünscht?
Veröffentlicht am 16/12/2016 um 13:31
vom benutzer bli
stimmen
0
antworten
1
aufrufe
47
Elegant umgehen Proben mit nicht genügend Daten in Workflow?
Veröffentlicht am 20/12/2016 um 19:57
vom benutzer Jon
stimmen
1
antworten
0
aufrufe
56
Definition von Funktionen für Geany „Dateityp“
Veröffentlicht am 04/01/2017 um 13:59
vom benutzer Gil Hornung
stimmen
2
antworten
0
aufrufe
299
Mit Regex in snakemake Platzhalter
Veröffentlicht am 04/01/2017 um 14:07
vom benutzer rioualen
stimmen
0
antworten
1
aufrufe
123